SureSeq Myeloid Fusion NGS Panel
Partner gene-agnostic fusion detection
- Evidenzbasiertes und zukunftsorientiertes Panel-Design
- Schneller und reibungsloser Arbeitsablauf mit der Universal NGS Complete Workflow Solution
- Kostenlose Datenanalyse-Software mit Interpret NGS Analyse Software
Das SureSeqTM Myeloid Fusion NGS Panel bietet
- ein Produkt, das in Zusammenarbeit mit Expertinnen und Experten für myeloischen Krebs auf der Grundlage der neuesten WHO-Richtlinien [1] entwickelt wurde. Es kombiniert ein von Expertinnen und Experten geleitetes Paneldesign mit hybridisierungsbasierter Anreicherung für eine hervorragende Einheitlichkeit und Abdeckungstiefe.
- ein RNA-basiertes Partnergen-agnostisches Panel, das 30 häufige myeloische Fusionen und neuartige Fusionspartner in einem einzigen kosteneffizienten Assay nachweist.
- eine vollständige Assay- und Softwarelösung mit optimierter Library-Vorbereitung und intuitiver, kostenloser Datenanalysesoftware.
Das RNA-basierte SureSeqTM Myeloid Fusion Panel zielt auf einzelne wichtige Fusionspartner ab und ermöglicht die Identifizierung von Treibergenen mit mehreren Partnern (z. B. KMT2A) und neuartigen oder seltenen Fusionen, was die Forschung zur Klassifizierung und Progression von myeloischem Krebs unterstützt. Dieser einzigartige Ansatz minimiert die Größe des Panels, was die Sequenzierungskosten senkt und eine größere Abdeckung für sensitivere Ergebnisse ermöglicht. Darüber hinaus dient das Panel zur Identifizierung von Genexpressionsveränderungen von MECOM und unterstützt die Identifizierung von GATA2-MECOM (inv(3)(q21.3q26.2) und RPN1-MECOM (inv(3)(q21q26).
Zielgene
| RBM15-MKL1 t(1;22)(p13.3;q13.3) | KMT2A-ELL t(11;19)(q23;p13.1) | FUS-ERG t(16;21)(p11.2;q22.2) | FGFR1-ZMYM2 |
| GATA2-MECOM (GATA2-EVI1) | KMT2A-MLLT1 (ENL) t(11;19) (q23;p13.3) | CBFB-MYH11 inv(16)(p13.1q22) | FIP1L1-PDGFRA del(4)(q12q12) |
| RPN1-MECOM (RPN1-EVI1) | KMT2A-AF6 (MLLT4; AFDN) t(6;11)(q27;q23) | RUNX1-RUNX1T1 (AML1-ETO) t(8;21)(q22;q22.1) | PDGFRB-EBF1 del(5)(q32q33) |
| DEK-NUP214 (DEK-CAN) t(6;9)(p23;q34.1) | KMT2A-MLLT11 t(1;11)(q21;q23) | ETV6-RUNX1 (TEL-AML1) t(12;21)(p13;q22) | PDGFRB-TNIP1 t(5;5)(q32;q33) |
| NUP98-NSD1 t(5;11)(q35.2;p15.4) | KMT2A-NEBL t(10;11)(p12;q23) | RUNX1-MECOM (AML1-EV1L) t(3;21)(q26.2;q22) | PDGFRB-ATF7IP t(5;12)(q33;p13) |
NUP98-HOXA9 | PML-RARα t(15;17)(q24;q21) | BCR-ABL1 t(9;22)(q34.1;q11.2) | PDGFRB-ETV6 t(5;12)(q33;p13) |
| PICALM-MLLT10 t(10;11)(p12.3;q14.2) | KAT6A-CREBBP t(8;16)(p11.2;p13.3) | NPM1-MLF1 t(3;5)(q25.1;q35.1) | |
| KMT2A-MLLT3 (AF9) t(9;11)(p21.3;q23.3) | PCM1-JAK2 | FGFR1-BCR t(8;22)(p11;q11) |
Abbildung 1: Konsistenter und sicherer Nachweis der MECOM-Überexpression in seriellen Verdünnungen der HNT-34-Zelllinie [A] sowie in Forschungs- und kommerziellen Proben, einschließlich positiver und negativer Kontrollen [B]. Die MECOM-Expression ist auf die Expression von Housekeeping-Genen normalisiert, und die Expressionswerte sind als Anzahl pro Million (counts per million, CPM) berechnet. ‚Research (+)‘ bezieht sich auf Forschungsproben, die GATA2-MECOM (inv(3)(q21.3q26.2)) enthalten. ‚Commercial (+)‘ bezieht sich auf die Universal Human Reference RNA (UHRR), die als Positivkontrolle verwendet wird. ‚Research (-)‘ bezieht sich auf aus Blut extrahierte RNA ohne GATA2-MECOM (inv(3) (q21.3q26.2)). ‚Commercial (-)‘ bezieht sich auf normale menschliche Lymphozyten-RNA, die als Negativkontrolle verwendet wurde. Die Fehlerbalken stellen die Standardabweichung dar.
Abb. 2: Interpret ermöglicht die Identifizierung von kanonischen Fusionen wie KMT2A-AFDN (MLLT4) und KMT2A-MLLT3 [A, B] sowie neuartigen Fusionen wie KMT2A-MLLT10 und KMT2A-MLLT6 [C, D], was die Eignung zur Partnergen-agnostischen Detektion von Fusionen unterstreicht.
Hämatologische NGS-Panels (OGT)
Entdecken Sie alle NGS Library Preparation Kits & Reagenzien (OGT)
References
[1] Khoury et al. Leukemia. 2022 ;36:1703-19.
Haftungsausschluss
SureSeqTM: Nur für Forschungszwecke, nicht zur Verwendung in diagnostischen Verfahren.
Hersteller und Trademark: SureSeqTM (Oxford Gene Technology IP Limited)
| Feature | Spezifikationen |
| Funktionen | Detektion von Fusionen und MECOM-Expression |
| Anzahl der Fusionen | 30 |
| Panel-Größe | 61 kb |
| Empfohlener RNA-Input | 200–500 ng RNA hoher Qualität (RIN ≥7) |
| Probenmaterial | Vollblut, aus Knochenmark extrahierte RNA |
Sysmex Deutschland GmbH
Bornbarch 1
22848 Norderstedt
+49 (40) 534 10 2-0
+ 49 (40) 523 23 02
Produkt-Dokumente
Regulatorische Dokumente
Auf regulatorische Dokumente, wie Bedienungsanleitungen, können Sie mit Ihrem Account in unserem Kundenportal zugreifen:
Zu My Sysmex
